A PMFC-MATIAS felnőtt és utánpótlás csapatainak működését három szervezet biztosítja. A PMFC-SPORT Kft. feladata egyrészt a felnőtt NBI-es gárda versenyeztetése, másrészről ide tartozik az U12-U19-es korosztályok működtetése. A Kft. képviselője Feleki Attila ügyvezető.
A Pécsi Mecsek Futball Club, amelyet az elnök Matyi Dezső képvisel a legkisebb korosztályok labdarúgásának biztosításáért felel. A PMFC-ben találhatóak gyermeklabdarúgóink az óvodásoktól egészen az U11-es, Bozsik-programban résztvevő csapatokig.
A legújabb szervezet, a 2011 szeptemberében alakult Pécsi Futballakadémia Alapítvány Dr. Soós Tamás elnök vezetésével az utánpótlás-nevelés fejlesztéséért jött létre. Együttműködési megállapodás alapján támogatja a másik két sportszervezetet; valamint üzemelteti az akadémiát és a kollégiumot.

PMFC-SPORT Szolgáltató és Kereskedelmi Kft.
Rövid név: PMFC-Sport Kft.
Alapítás éve: 1998
Székhely: 7633 Pécs, Stadion u. 2.
Képviseli: Feleki Attila ügyvezető
Cégjegyzékszám: 02 09 066901
Adószám: 11604598-2-02
Statisztikai számjel: 11604598-9319-113-02
Bankszámlaszám: 12072507-00345614-00100000 (Raiffeisen Bank )

Pécsi Mecsek Futball Club
Rövid név: PMFC
Alapítás éve: 1950
Székhely: 7633 Pécs, Stadion u. 2.
Képviseli: Matyi Dezső elnök
Bejegyzési határozat száma: 60183 / 1995 . 30
Adószám: 18306318-2-02
Bankszámlaszám: 14100017-87245549-01000002 (Volksbank)

Pécsi Futballakadémia Alapítvány
Rövid név: PFA
Alapítás éve: 2010
Székhely: 7633 Pécs, Stadion u. 2.
Képviseli: Dr. Soós Tamás elnök
Bejegyzési határozat száma: Baranya Megyei Bíróság Pk. 60.027/2010.szám
Adószám: 18220894-2-02
Bankszámlaszám: 50800111-11207191 (Szigetvári Takarék)